L’Azienda adotta come modello di gestione operativa delle attività assistenziali il Dipartimento ad Attività Integrata (DAI), adottano una gestione unitaria delle risorse economiche, umane e strumentali  assegnate e garantiscono l’integrazione con la didattica e la ricerca universitaria. I DAI possono essere organizzati all’interno di un presidio o tra i presidi dell’Azienda.

I Dipartimenti si compongono di strutture organizzative denominate Strutture Organizzative Dipartimentali (SOD) che mantengono la propria autonomia, responsabilità clinico-professionale e gestionale nell’ambito dei compiti e delle risorse attribuite dal Direttore del Dipartimento.